Amigo Juan Erena,
Habrá que esperar hasta la convocatoria de oposiciones (si es que finalmente se convocan) para poder contestar con más seguridad a tu pregunta.
En la convocatoria de 2012, no se decía nada expresamente sobre las transcripciones:
Interpretación, durante un tiempo máximo de veinte minutos, de un programa de concierto elegido por el personal opositor en el que estén incluidas, al menos, cuatro obras representativas de los principales estilos de la literatura del instrumento. Todas las obras deberán estar publicadas.
(ORDEN de 13 de febrero de 2012, BOJA 36, 22 de febrero de 2012, pp. 41-42)
Dejo a vuestra consideración decidir si las transcripciones, en general, o una transcripción en concreto representa uno de los estilos principales de la literatura guitarrística. También en la en la p. 42 de la convocatoria, leemos:
Se valorará la dificultad técnica, la calidad y destreza de la ejecución y la correcta interpretación del programa presentado.
La redacción no es muy afortunada, pero parece que el tribunal podía valorar la "calidad" del programa presentado y ahí podrían ser más o menos benévolos con ciertas obras y con ciertas transcripciones.