A ver...Una vez que eliges el tiro de tu instrumento (en tu caso 440mm) ahora debes elegir dónde quieres situar el traste 12 (que en caso de la guitarra española se suele situar justo donde empieza la caja). Una vez elegido esto, el puente quedará determinado en su sitio (compensaciones aparte). Otra opción es situar el puente donde quieras en la caja y, por lo tanto, el traste 12 quedará justo en la mitad de donde has situado el puente y la cejuela (en este caso el traste 12 no te saldría, en general, a ras de la caja....cosa que ocurre en las guitarras acústicas, eléctricas, etc.). ¿Que qué es mejor? Creo que ni se sabe, pero yo me guiaría o mejor dicho me dejaría influenciar por el diseño de de Torres y cualquier instrumento de cuerdas lo construiría a escala con éste situando el traste 12 a ras con la caja (aunque dependerá mucho -sobre todo estéticamente- de la forma de la caja del instrumento).
Lo que no entiendo es lo que dices de "una especie de mini guitarra COMO de 440 de tiro", porque el tiro es la distancia entre la cejuela y el puente. Así, si elijes 440mm de tiro (o sea, que ya sabes dónde va el puente), el traste 12 viene ya situado en su lugar (sólo habría un lugar posible, que sería justamente la mitad del tiro).